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Bureau d'études environnement
AU SERVICE DE
LA BIODIVERSITÉ


Bureau d'études environnement
AU SERVICE DE
LA BIODIVERSITÉ

L'agence
Que faisons-nous ?
Faire une place au vivant dans les projets
Ce qu'on maitrise parfaitement
L'évaluation de la biodiversité
Ce qui nous porte
La nature en ville,
l'écologie urbaine,
la renaturation
Indispensable pour des projets réussis
L'accompagnement réglementaire

L'équipe
Qui sommes-nous ?
Ubiquiste,
vos expert·es écologues
L’agence, indépendante et basée à Lyon, est née en 2020 d'une conviction : faire le lien entre connaissance scientifique et action opérationnelle.
Notre équipe réunit ingénieur·es-écologues et naturalistes aux compétences complémentaires.
Certain·es passent leurs journées sur le terrain, d’autres conseillent et accompagnent concepteurs et maîtres d'ouvrage.
Expertises
Que faisons-nous ?
Comprendre, accompagner et suivre
Des inventaires naturalistes à la modélisation écologique, jusqu’à l’accompagnement opérationnel des projets, nous mobilisons des expertises complémentaires pour éclairer les décisions à toutes les étapes des projets.
Engagement et innovation : chez Ubiquiste, la R&D fait partie de notre ADN. Nous faisons de la recherche un véritable levier d’action en développant continuellement des outils pour simuler les impacts écologiques des projets.
En 2025, nous avons lancé le projet d'une thèse Cifre et poursuivons nos collaborations universitaires et la valorisation scientifique de l'ensemble de nos travaux.
Nous réalisons des diagnostics écologiques et des inventaires naturalistes pour identifier les espèces et les habitats présents sur un site, et comprendre les enjeux de biodiversité associés.
Selon les besoins du projet, ces études peuvent prendre la forme de diagnostics rapides ou d’inventaires complets sur plusieurs saisons. Elles permettent d’anticiper les contraintes réglementaires et d’orienter les projets dès les premières étapes.
Parce que chaque territoire et chaque projet présentent des enjeux spécifiques, nos méthodologies sont conçues sur mesure. Nous réalisons des inventaires sur différents groupes taxonomiques : flore et habitats naturels, zones humides, avifaune, mammifères terrestres et chiroptères, herpétofaune (amphibiens et reptiles), insectes, etc.
En évaluant les incidences potentielles des projets sur la biodiversité et en identifiant les mesures permettant de les éviter ou de les réduire, nous accompagnons la maîtrise d’ouvrage dans les démarches d’autorisation environnementale : examen au cas par cas, dérogation espèces protégées, études d’impact, etc.
Nous accompagnons collectivités, aménageurs et maîtres d’ouvrage pour intégrer la biodiversité dans leurs projets et leurs stratégies territoriales.
Nous mobilisons nos expertises en écologie pour construire des stratégies adaptées aux enjeux écologiques, aux contraintes des projets et aux dynamiques locales.
Cet accompagnement se traduit par une collaboration étroite avec les équipes de conception, une participation aux réunions de projet, une assistance à maîtrise d’ouvrage sur les enjeux réglementaires, une relecture et amendement de pièces techniques, la définition de mesures écologiques et d'ingénierie du vivant.
Nous analysons les continuités écologiques afin de comprendre comment les espèces circulent et utilisent les milieux à l’échelle d’un site, d’un paysage ou d’un territoire
Pour cela, nous mobilisons des outils de modélisation spatiale et des approches d’écologie du paysage permettant d’identifier les réservoirs de biodiversité, les corridors écologiques et les obstacles aux déplacements des espèces (trame verte et bleue, trame noire, trame turquoise).
Chez Ubiquiste, la modélisation constitue notre savoir-faire historique que nous appliquons du site au grand territoire, et dans de nombreux projets de recherche appliquée.
Renaturer les sols, c’est repenser les usages à partir de leurs fonctions écologiques dans un contexte de reconquête de la biodiversité et d'adaptation aux changements globaux.
Nous mobilisons ainsi une expertise croisée en pédologie, écologie, urbanisme et paysage pour faire des sols un levier d’adaptation et de résilience. Diagnostics écologiques, trame brune, gestion des sols et désimperméabilisation nous permettent d’intégrer les sols comme un véritable support du projet.
Nous élaborons des plans de gestion écologique pour accompagner les gestionnaires et les collectivités dans la mise en œuvre de pratiques d’entretien des espaces naturels et urbains en faveur du vivant.
Parcs, espaces naturels ou sites urbains : nos orientations et protocoles de gestion différenciée sont adaptés à chaque contexte et aux usages des lieux. Ils visent à concilier les objectifs de conservation de la biodiversité, la faisabilité technique et les moyens des gestionnaires.
Coordination écologique en réalisation, suivi des espèces protégées, appui aux entreprises : nous accompagnons les projets au plus près de la réalité des chantiers pour garantir la bonne mise en œuvre des engagements environnementaux.
Nous veillons, pour les porteurs de projet, à l’application concrète des mesures écologiques. Nos interventions reposent sur la pédagogie, la réactivité et le dialogue avec les équipes de maîtrise d’œuvre, les entreprises et l’ensemble des acteurs du chantier.
Inventaire faune-flore pour la section en site propre de la ligne « Express Chevigny »

Diagnostic écologique, mission de conseil et accompagnement à l'élaboration des dossiers réglementaires.
— Mars 2025
Dijon Métropole
Journées Eau et biodiversité de l'Agence de l'eau Rhône-Méditerranée-Corse

Présentation des défis et des apports de la modélisation pour la gestion de la trame turquoise, auprès de plus de 80 technicien·nes de l'AERMC.
— Mars 2025
Diagnostic de la faune protégée du bâti de la DSDEN et du Palais de la Recherche Chevreul

Évaluation des liés à la faune inféodé au bâti et accompagnement préalable à des travaux de rénovation énergétique.
— Mars 2025
Rectorat de Lyon et Université Lyon 3
Appel à contribution de retours d'expérience de MitiConnect

Lancement d'un appel à contribution dans le cadre du Centre de ressources Trame verte et bleue pour alimenter une synthèse de retours d'expérience.